BebopとRocksteadyのコンビがチャンネル6を襲撃し、超危険なデバイスを強奪した時、タートルズは怪しげなことが起こっていることを知る。『ミュータント タートルズ：シュレッダーの復讐』は、従来のTMNTでお馴染みの場所を舞台に甲羅をもつヒーローたちが戦う、タートルズの快進撃だ！

異なる16のレベルをクリアし、危険な忍者コンボを駆使してBaxter Stockmanやトリケラトンなどの従来の敵を倒そう！